你是cli模式还是cgi模式？cli模式不用设默认就是无时间限制，cgi默认是有30秒超时限制。
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你可以先看看每次中断是固定时长，还是固定次数；也可以多打日志，每次循环都输出些参考参数如循环条件、内存使用等信息，再分析哪些可能导致程序中断的原因。
你用网页的方式，让人点击，服务器采集，简直是弱爆了。每个人的点击循环1000次，来个100人同时点，你要用的是普通的虚拟机就不行了。
最好是换种方式实现，不要通过网页进行采集。
可以非常简单的在数据库的表，创建一个采集队列，后台执行一个crontab的计划任务，去完成队列里的采集任务。
?php
mysql_connect("localhost", "mysql_user", "mysql_password") or
die("Could not connect: " . mysql_error());//连接你的数据库
mysql_select_db("mydb");//选择你的数据库
$result = mysql_query("SELECT `name` FROM data_boy WHERE `id`='2' LIMIT 0, 60");//执行SQL查询语句,搜索出60条数据
while ($row = mysql_fetch_array($result)) {
echo "姓名:".$row[name]."br";
/*补充一句，此处也可以是：
echo "姓名:".$row[0]."br";此处"mysql_fetch_array"默认返回的既有 关联数组（字段作为键名），也有数字索引数组*/
}
mysql_free_result($result);//释放结果
1W条数据量也不是特别大，那就直接读取，然后在foreach入库就可以了
如果数据量非常大的时候，那就分段读取，然后入库~
考虑到php超时，那就网页端打开，第一部分执行完，刷新页面，开始执行第二部分，依次进行...
当然，直接在命令行下执行也可以~