网上有用的资料不多，在一本电子书中摘抄了内容如下
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webControls配置节只有一个clientScriptsLocation属性，此属性用于指定ASP.NET客户端脚本的默认存放路径。这些文件是包含在HTML代码生成的ASPX页面时这些需要的客户端功能，如智能导航和客户端控件验证。
上述代码就是
ASP.NET 4不使用这个文件夹来储存客户端脚本文件。实际上客户端脚本文件以资源的形式嵌入到system.web程序集中。并且通过webresource.axd HTTP handler注入到页面中。
你可以使用客户端脚本文件夹来保存给自定义的ASP.NET控件使用的脚本文件。
感觉这个真的已经被废弃了，并且在.NET Framework4.6的源码中查看webControlsSection类时也没发现有任何代码对这个类进行调用了，鄙人尝试过在一个WebForm页面中拖了一个验证控件RequiredFieldValidator，在生成的html代码中多了两个js脚本的引用
可以得出已经把脚本文件嵌入到程序集里面，通过webresource.axd来获取到对应的资源。实际上这里可嵌入的资源不单指js了，还可以是图片文件。
出于好奇我就看了一下RequiredFieldValidator的代码，
发现里面有一行代码是把js文件注册进去
于是自己也尝试了一下
ClientScript是ClientScriptManager的一个实例，js的文件名是js2.js，前面需要附带设这个程序集的默认命名空间 这里用到的，js2.js文件是放在网站根目录下。
文件 的属性是这样设置
运行了页面看看生成的html多了一个js的引用
疑惑的是为啥ValidatorBase里面的嵌入js时不需要用到不需要命名空间，MSDN上的例子也是中规中矩地加上了命名空间。难道还有别的方式给它加命名空间？
但是还是有点不服气，看看原有的aspnet_client怎么弄出来，后来又发现了通过aspnet_regiis，可以添加aspnet_client。尝试了确实可以加，但是没啥效果，当初还猜想会不会是配置文件的webControls配置会影响生成文件夹的名字，后来发现我的猜想错了，还是生成aspnet_client。看来还是在.NET 1.0版本中使用，后续版本就换用webresource.axd。而且现在也用ASP.NET MVC，这个属于在webForm中使用，现在鄙人还是感觉把js放出来不嵌入到程序集里面还是不方便，修改了js又要编译代码。