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javac是编译java文件，编译后的java文件，是创建了包名的一个文件路径，比如直接执行javac A.java，那么会在当前目录下创建如下class文件：a/b/A.class
2.
2当执行java命令的时候，如果还在当前目录下执行java命令就会报错，因为在当前目录下，并不能找到A.class。
3.
当越包引用的时候，如题。那么在执行javac A.java到时候，编译器会寻找a/c/B.class文件，如果没有编译B.java文件，那么就不会存在a/c/B.class文件，就会报错了。所以在执行javac A.java的时候，要首先编译该类调用的其它包中的所有文件。
4.
sun还有一个编译工具叫Ant，这个东西可以比较轻易的解决这个问题，具体Ant的使用就自己查资料吧。事实上各种的编译软件都是使用Ant编译的。除非他自己写一个类似功能的软件。
用Runtime类可以执行DOS命令来执行一个进程，如下就是打开记事本:
try {
Runtime runtime = Runtime.getRuntime();
runtime.exec("notepad.exe");
} catch (IOException e) {
e.printStackTrace();
}
Thread是线程，不是进程，楼主可以去查查线程和进程的区别。
运行main函数时，就启动了一个java.exe进程，对应的dos命令就是java xxx
楼主可以用Runtime 来执行，java xxx，只要路径正确，就会启动另一个java进程。
java -classpath 类库 包名
在windows下和在unix/linux下执行命令基本一致。