看你想怎么使用PHP的数据。比如我从数据库里拿出一个数据，然后echo
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h1?php echo $title; ?/h1
那你JS里就可以通过DOM来获取h1的innerHTML
不要直接用js，最好用现成的library,比如jQuery，Prototype之类的，因为他们有浏览器兼容。
还有就是用ajax，动态获取你要的内容。即通过JS代码，调用PHP代码，然后传递回你要的数据。
AJAX非常的流行，因为不会造成网页停滞，强调的是asynchronous (不同步)。
php给javascript传值，算是两个方法吧，
一个就是主动刷新，php把值写到页面上，比如 var a='?php echo $a;?';
另外的方法就是通过js异步去拉取，通过ajax来实现，大体过程是：js 发起一个异步请求给php程序，php返回数据库的数据，js通过接收这个数据来在做处理。
1：HTML中的值如何传到JS,下面假设是文件1.php
代码如下:
html
body
form action="1.php" method="post"
name:input type="text" name="username" id="username"
rename:input type="text" name="username1" id="username1"
input type="button" value="submit" on CliCk="get()"
/form
/body
/html
JS假如想取文本框中用户输入的name值，这样写
代码如下:
script language='JavaScript'
function get()
{
var n=document.getElementById('username').value;
alert (n);
}/script
这样的话在有调用JS get()时就会弹出警示框，里面的内容就是name的值。
2:假如说JS中的这个取到的name值要传回rename的文本框中，这样写
代码如下:
script language='JavaScript'
function get()
{
var n=document.getElementById('username').value;
document.getElementById("username1").value=n;
}/script
这样的话在下面调用get()就会自动显示上面name输入的值。
3：PHP中取页面的值
代码如下:
?php
$name=$_REQUEST["username"];
echo $name;
?
4：PHP的值传回页面
在HTML中插入PHP语言，可以调用PHP中变量的值，也可用Smarty（推荐）。
有了以上这些，不管是HTML页面里的值还是JS中变量的值，都可以轻松的传入PHP，当然，PHP的值也可传到想要的地方。
用Ajax， PHP 跟 JS 最直接的交互方式就是 Ajax。
使用 Ajax 向服务器发起网络请求，PHP在后端进行处理并返回数据。
把对象数组转成JASON串，PHP收到后转化成JASON对象进行读取。
参考例子如下：
script type="text/javascript" src=""/script!--倒入json.js文件，序列化json对象用的--
script type="text/javascript" src=""/script
script type="text/javascript"
var zNodes =[
{ id:1, pId:0, name:"随意勾选 1", open:true},
{ id:11, pId:1, name:"随意勾选 1-1", open:true},
{ id:111, pId:11, name:"随意勾选 1-1-1"},
{ id:112, pId:11, name:"随意勾选 1-1-2"},
{ id:12, pId:1, name:"随意勾选 1-2", open:true},
{ id:121, pId:12, name:"随意勾选 1-2-1"},
{ id:122, pId:12, name:"随意勾选 1-2-2"},
{ id:2, pId:0, name:"随意勾选 2", checked:true, open:true},
{ id:21, pId:2, name:"随意勾选 2-1"},
{ id:22, pId:2, name:"随意勾选 2-2", open:true},
{ id:221, pId:22, name:"随意勾选 2-2-1", checked:true},
{ id:222, pId:22, name:"随意勾选 2-2-2"},
{ id:23, pId:2, name:"随意勾选 2-3"}
];
$.ajax({
url:'xxxx.php'//改为你的动态页
,type:'POST'
,data:{zNodes:zNodes.toJSONString()}//调用json.js类库将json对象转换为对应的JSON结构字符串
,success:function(rst){alert('PHP接收JSON数据成功！');}
,error:function(xhr){alert('PHP页面有错误！'+xhr.responseText);}
}});
/script
$zNodes=$_POST["zNodes"];
$json=json_decode($zNodes);//转化为JSON对象
很简单。。。举例
$message = "这是一个来自 php 的值。";
echo "script language=\"JavaScript\" type=\"text/JavaScript\";\r\n!--\r\n alert('".$message."');\r\n--;\r\n/script;";你得把所有的JS代码转成PHP格式就可以了。