在windows下一般是更改mysql安装目录的my.ini文件，把里面那个port=3306更改你想要的端口 在Linux下，一般是更改/etc/my.cnf文件，把里面那个port=3306更改你想要的端口 这样更改完端口，重启下服务就可以。这更改后的端口最好是1024后面的端口...
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1. 登录mysql
[root@test /]# mysql -u root -p
Enter password:
2. 使用命令show global variables like 'port';查看端口号
mysql show global variables like 'port';
+---------------+-------+
| Variable_name | Value |
+---------------+-------+
| port | 3306 |
+---------------+-------+
1 row in set (0.00 sec)
3. 修改端口，
编辑/etc/my.cnf文件，早期版本有可能是my.conf文件名，增加端口参数，并且设定端口，注意该端口未被使用，保存退出。
[root@test etc]# vi my.cnf
[mysqld]
port=3506
datadir=/var/lib/mysql
socket=/var/lib/mysql/mysql.sock
user=mysql
# Disabling symbolic-links is recommended to prevent assorted security risks
symbolic-links=0
[mysqld_safe]
log-error=/var/log/mysqld.log
pid-file=/var/run/mysqld/mysqld.pid
"my.cnf" 11L, 261C written
[root@test etc]#
4. 重新启动mysql
[root@test ~]# systemctl restart mysqld
5.再次登录后检查端口已修改为’3506’.
[root@test etc]# mysql -u root -p
Enter password:
Welcome to the MySQL monitor. Commands end with ; or \g.
Your MySQL connection id is 2
Server version: 5.1.66 Source distribution
Copyright (c) 2000, 2012, Oracle and/or its affiliates. All rights reserved.
一般情况下都在安装目录下，如果不再的话，就找一下c:\windows、c:\windows\system32下面或者使用windows的搜索功能找一下my.ini。
例如我的在：D:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.1\my.ini
如果是XAMPP安装方式的就在xampp\mysql目录下的相关.ini文件。
修改下面两个地方：[client]
port=3306
[mysqld]
# The TCP/IP Port the MySQL Server will listen onport=3306
然后将3306改为你想要的端口号
备注：有两个"port=3306"，都需要改
3
如果提示修改不了可能需要把相关软件和服务先停掉，win7的可能要以管理员方式打开，修改后要重启服务才起作用。
修改文件：my.ini or my.cnf 批量修改3306 替换成你要的端口号即可，保存重启mysql服务
在配置文件里添加比如3307
[mysqld]
port=3307 在你的系统目录下有一个my.ini 文件，
WIN98下在WINDOWS
WINNT在WINNT
WINXP在WINDOWS
内容如下
[mysqld]
basedir=D:/MYSQL
#bind-address=192.168.0.2
datadir=D:/MYSQL/data
language=D:/MYSQL/share/chinese
#tmpdir#=
#port=3306
其中port=3306就是端口了，
将#去掉就行了
新版本的mysql 有很多 如 my-large.ini 都需要修改