大哥，你的意思是将一个正在运行的完整的Linux系统复制到U盘中？ 首先，Linux系统正在运行，很多文件在使用中，无法复制是理所当然（这个和windows同理）。真想复制，也要在救援模式下（这样在一个临时的系统中）挂在这个系统，再复制就OK； 其次，你这样复制一个系统有什么意义？ 它也不能启动呀？如果真想复制数据，也没有必要这样。
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cp命令
该命令的功能是将给出的文件或目录拷贝到另一文件或目录中，同MSDOS下的copy命令一样，功能十分强大。
语法： cp [选项] 源文件或目录 目标文件或目录
说明：该命令把指定的源文件复制到目标文件或把多个源文件复制到目标目录中。
该命令的各选项含义如下：
- a 该选项通常在拷贝目录时使用。它保留链接、文件属性，并递归地拷贝目录，其作用等于dpR选项的组合。
- d 拷贝时保留链接。
- f 删除已经存在的目标文件而不提示。
- i 和f选项相反，在覆盖目标文件之前将给出提示要求用户确认。回答y时目标文件将被覆盖，是交互式拷贝。
- p 此时cp除复制源文件的内容外，还将把其修改时间和访问权限也复制到新文件中。
- r 若给出的源文件是一目录文件，此时cp将递归复制该目录下所有的子目录和文件。此时目标文件必须为一个目录名。
- l 不作拷贝，只是链接文件。
需要说明的是，为防止用户在不经意的情况下用cp命令破坏另一个文件，如用户指定的目标文件名已存在，用cp命令拷贝文件后，这个文件就会被新源文件覆盖，因此，建议用户在使用cp命令拷贝文件时，最好使用i选项。
例子：
Cp -i file1 file2 (将文档 file1 复制成 file2 . –i为提示确认。)
cp file1 dir1 将文档 file1 复制到目录 dir1 下，文件名仍为 file1.
cp /tmp/file1 . 将目录 /tmp 下的文档 file1复制到现行目录下，档名仍为 file1.
cp /tmp/file1 file2 将目录 /tmp 下的文档 file1现行目录下，档名为file2
cp -r dir1 dir2 (recursive copy) 复制整个目录.若目录 dir2 不存在，则将目录dir1，及其所有文档和子目录，复制到目录 dir2 下，新目录名称为dir1.若目录dir2不存在，则将dir1，及其所有文档和子目录，复制为目录 dir2.
1、在终端下：
复制命令：Ctrl + Shift + C 组合键。
粘贴命令：Ctrl + Shift + V 组合键。
2、在控制台下：
复制命令：Ctrl + Insert 组合键或用鼠标选中即是复制。
粘贴命令：Shift + Insert 组合键或单击鼠标滚轮即为粘贴。
目标机器上当前目录应该是/root，你可以用pwd确认一下
如果/home下原来有root目录，文件在/home/root目录下；没有root目录，则文件传到/home下，并改名为root
cp -rf 目录名 目录路径
cp (复制档案或目录)
参数：
-a ：相当于 -pdr 的意思；
-d ：若来源文件为连结文件的属性(link file)，则复制连结文件属性而非档案本身；
-f ：为强制 (force) 的意思，若有重复或其它疑问时，不会询问使用者，而强制复制；
-i ：若目的档(destination)已经存在时，在覆盖时会先询问是否真的动作！
-l ：进行硬式连结 (hard link) 的连结档建立，而非复制档案本身；
-p ：连同档案的属性一起复制过去，而非使用预设属性；