我用过MySQL，也用过PD，但是没有处理过像您这样的问题。倒不图什么分不分的，谈一点我的看法，也许对你有用。
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1、都是Sybase公司的产品，我建议您线装个PowerBuilder，版本最好9.0以上，如果这个可以直接访问MySQL的数据库，说明您的机器环境没问题，而且产品接口也没问题，再继续，如果有问题估计就得重装数据库或客户端连接工具了；
2、接口问题，如果能够直接使用MySQL的客户端连接最好，尽量不要用ODBC，微软转换过的东西就靠谱了；
3、如果用ODBC连，您可以尝试先用ACCESS通过ODBC导入数据的方式创建个表，先确认下连接有效性，然后试试ODBC接口的连接（不靠谱也没办法）。
我也不知道思路对否，但愿对您有帮助。
在 Python 语言环境下我们这样连接数据库。
In [1]: from mysql import connector
In [2]: cnx = connector.connect(host="172.16.192.100",port=3306,user="appuser",password="xxxxxx")
但是连接数据库的背后发生了什么呢？
答案
当我们通过驱动程序（mysql-connector-python,pymysql）连接 MySQL 服务端的时候，就是把连接参数传递给驱动程序，驱动程序再根据参数会发起到 MySQL 服务端的 TCP 连接。当 TCP 连接建立之后驱动程序与服务端之间会按特定的格式和次序交换数据包，数据包的格式和发送次序由 MySQL 协议 规定。MySQL 协议：整个连接的过程中 MySQL 服务端与驱动程序之间，按如下的次序发送了这些包。
MySQL 服务端向客户端发送一个握手包，包里记录了 MySQL-Server 的版本，默认的授权插件，密码盐值（auth-data）。
2. MySQL 客户端发出 ssl 连接请求包（如果有必要的话）。
3. MySQL 客户端发出握手包的响应包，这个包时记录了用户名，密码加密后的串，客户端属性，等等其它信息。
4. MySQL 服务端发出响应包，这个包里记录了登录是否成功，如果没有成功也会给出错误信息。
原料：1、oracle odbc驱动（64位 现在没几个用32位的了）
2、Powerdesigner16.5 sp05 （很大800多M）
步骤：1、安装odbc驱动
我下载的base包：instantclient-basic-windows.x64-11.2.0.3.0.zip
ODBC包：instantclient-odbc-windows.x64-11.2.0.3.0.zip
两个包的版本必须要一致才行。