区别如下：
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1、yum -y update 升级所有包，改变软件设置和系统设置,系统版本内核都升级。
2、yum -y upgrade升级所有包，不改变软件设置和系统设置，系统版本升级，内核不改变。
linux yum命令详解：
1、yum（全称为 Yellow dog Updater, Modified）是一个在Fedora和RedHat以及SUSE中的Shell前端软件包管理器，基於RPM包管理，能够从指定的服务器自动下载RPM包并且安装，可以自动处理依赖性关系，并且一次安装所有依赖的软体包，无须繁琐地一次次下载、安装，yum提供了查找、安装、删除某一个、一组甚至全部软件包的命令，而且命令简洁而又好记。
2、yum的命令形式一般是如下：yum [options] [command] [package ...]其中的[options]是可选的，[command]为所要进行的操作，[package ...]是操作的对象。
yum update：升级所有包同时也升级软件和系统内核
yum upgrade：只升级所有包，不升级软件和系统内核
扩展：
Yum（全称为 Yellow dog Updater, Modified）是一个在Fedora和RedHat以及CentOS中的Shell前端软件包管理器。基于RPM包管理，能够从指定的服务器自动下载RPM包并且安装，可以自动处理依赖性关系，并且一次安装所有依赖的软件包，无须繁琐地一次次下载、安装。
linux系统当然有漏洞，linux的更新是很快的。一般几个月半年就有一个小版本更新，不只是漏洞还有新功能。
一般叫系统更新，可以使用系统自带的更新工具。或是用yum upgrade或apt-get 这些命令，看系统而定。当然就是全自动了。
当然可以手动，但要知道自己想更新什么以及下载所有包，很难找。
一般linux给某个特定软件打补丁用patch命令。
1、sudo apt-get update 更新源，从服务器下载软件列表，同步服务器的软件包数据；
2、sudo apt-get upgrade 安装可用更新；
3、sudo apt-cache search package_name 查询软件包；
4、sudo apt-get install package_name 安装一个软件包；
5、sudo apt-get remove package 删除一个软件包；
6、sudo apt-get help 查看apt-get 命令帮助；