我一般用二种方法：
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1.SQL文件数据备份；
下载一个Navicat Premium，使用这个软件，正确连接并访问数据库，
点中你想要备份的数据库，按右键使用转存SQL文件，就会出现你要备份的提示框，保存即可；
若要导进则用运行SQL文件，非常方便的导入单个数据库的，但这种只适合于小数据量的数据库（50万条以下）；
2.底层备份，但这种备份要求安装是同一版本的mysql才适合，否则会出现未知错误；
直接找到mysql安装目录，找到data文件夹全部拷呗到你想备份的地方即可，还原就拷回来即可。适合大数据量的备份方法！
3.至于楼主硬要用PHP备份数据的话，你可以参考phpadmin和dedecms程序备份数据的方法，但这种执行效率很低的！
1.打开数据库备份页面
//php代码，导出数据库
public function exportSql() {
$dbName = C('DB_NAME'); //读取配置文件中的数据库用户名、密码、数据库名
$dbUser = C('DB_USER');
$dbPwd = C('DB_PWD');
$fileName = date("Y-m-d")."_".$dbName.".sql";
$dumpFileName = "./sql_backup/".$fileName;
exec("D:/xampp/mysql/bin/mysqldump -u$dbUser -p$dbPwd $dbName $dumpFileName");
}
2.php exec函数，执行外部程序命令
exec(“D:/xampp/mysql/bin/mysqldump -u$dbUser -p$dbPwd $dbName $dumpFileName”);
此处执行mysqldump命令，导出数据库到$dumpFileName中，“D:/xampp/mysql/bin/”为mysqldump所在位置，“-u$dbUser -p$dbPwd”数据库的用户名和密码（中间不要加空格），$dbName为要导出数据库的名字
linux系统自带crontab计划任务，可以满足你的需求。
编辑crontab配置文件的方法是：
crontab -e
编辑完成后，用:x组合键关闭并保存。不需要重启操作，时间到了以后，系统会自动调用定时任务。
示例，在凌晨4点重启lighthttpd：
0 4 * * * /usr/local/etc/rc.d/lighttpd restart
将命令的路径改为你写的备份脚本。
望采纳！
使用mysqldump函数
mysqldump -u username -p dbname table1 table2 ... BackupName.sql
dbname参数表示数据库的名称
table1和table2参数表示需要备份的表的名称，为空则整个数据库备份；
BackupName.sql参数表设计备份文件的名称，文件名前面可以加上一个绝对路径。通常将数据库被分成一个后缀名为sql的文件。
备份数据库的主要过程：
切换到对应的数据库；
使用show create table tableName，获得表结构，写到文件中；
然后查询所有的表数据，循环生成相对应sql语句，写到文件中；
试运行生成的sql文件。
首先，登录mysql管理中心，找到您要备份的数据库。
然后，找到菜单“导出”，跳转到的页面，点击确定即可。