ArcGIS，优点：全面强大的GIS功能，10已经推出，ARCGIS从此支持云GIS、时间GIS，确实是强的“一塌糊涂”，同时追求GIS-RS一体化，切实感受过，还是不错的。开发方面，ArcObjects10带来了一些新的功能和更好的体验，比如Add-in、Graphics Tracker、Basemap layers等。在三维方面，ArcGIS的进步是明显的，在提升数据显示性能的同时加强了对3D数据的创建和管理能力，丰富和完善了诸多3D环境下的分析功能，力图使用户感受一个不仅只能Show，更注重强大分析功能的3D GIS。
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ArcGIS，缺点：贵。
MapGIS，优点：优秀的本土GIS，进步神速，有较强的创新能力。目前最高版本k9，与MapGIS 7相比，MapGIS K9大大提高了海量数据的浏览和查询速度，还可满足用户长时间并发访问的要求，可以根据已有数据回溯过去某一时刻的情况或预测将来某一时刻的情况，以满足历史回溯和衍变、地籍变更、环境变化、灾难预警等应用的需要。MapGIS K9可对地下三维地质模型、地上三维景观模型、地表三维地形模型等进行快速建立和一体化管理，并可对三维数据进行综合可视化和融合分析。MapGIS K9还具有功能齐全的遥感数据处理平台，从机载原始数据到正射影像生成、从影像分析到影像建库、从综合处理到专题信息提取等等，这些强大的功能已集成在MAPGIS K9的功能仓库中，可随意搭建成适应各专业的影像数据处理平台或GIS与影像相结合的综合处理平台。
MapGIS，缺点：不同时期的包包很多，说明还在不断完善。
supermap，优点：功能齐全，二次开发简洁快速，整体运作效率很不错的，数据分析的优势比较明显。
supermap，缺点：数据处理偏弱。
MapInfo，优点：做的比较早，群众基础广泛，很多老数据也是MapInfp出的，个人觉得MapInfo主要功能还是数据处理上
MapInfo，缺点：高级空间分析弱
GeoStar 、TopMap、GeoBeans、GeoImageDB、GeoTinGeoGrid等软件一直没机会使用，有必要的话楼主自己去体验吧。
有很多开源的GIS软件都是免费的。比如QGIS和MAPWINGIS等。QGIS稍微复杂一些，但是功能更全，还跨平台。MAPWINGIS主要争对WINDOWS平台。
在这个页面下载mapwindow5即可。
GIS三维开发可以用ArcGIS组件中的SceneControle控件和GlobeDisplay对象。三维SceneControl控件用于展示三维场景，GlobeDisplay对象用于三维分析。ArcGIS中的ArcScene对三维GIS制作和三维空间分析做的很精细，很适合三维制作和分析，可以制作用于三维开发的地图文档。
希望我的回答对你有用
GIS == Geographic Information System （地理信息系统）。
最简单地来说，GIS是以测绘测量为基础，以数据库作为数据储存和使用的数据源，以计算机编程为平台的全球空间分析即使技术。这是GIS的本质，也是核心。GIS即地理信息系统（Geographic Information System），经过了40年的发展，到今天已经逐渐成为一门相当成熟的技术，并且得到了极广泛的应用。尤其是近些年，GIS更以其强大的地理信息空间分析功能，在GPS及路径优化中发挥着越来越重要的作用。GIS地理信息系统是以地理空间数据库为基础，在计算机软硬件的支持下，运用系统工程和信息科学的理论，科学管理和综合分析具有空间内涵的地理数据，以提供管理、决策等所需信息的技术系统。简单的说，地理信息系统就是综合处理和分析地理空间数据的一种技术系统。
软件主要包括以下几类：操作系统软件 、数据库管理软件 、系统开发软件 、GIS 软件，等等。GIS常用软件AutoCAD Map3d，ArcGIS（包括ArcGIS, MapObjects, ArcIMS、ArcSDE、ArcEngine、ArcServer等），MapInfo，MapGIS（MapGISK9基础平台、数据中心集成开发平台等，目前国内市场份额最大的软件系列），SuperMap等。