自上而下是说的同一函数内的顺序和函数调用顺序，不是指的文件里的行号。例如无论写在第几行，main函数都是要首先运行的。
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在你要结束的地方添加System.exit(0);就行了，执行改行代码后，当前程序就会结束
本来用DWR调用方法就是多线程的，线程总数与J2EE容器配置的有关。
建议如下：
如果你这个A()调用的接口一次只允许一个访问，那么需要在A所在的类里设置一个静态成员变量，如static
String
object
=
"some"。
然后在A()方法一开始用synchronized
(object)
{..
}把代码都包含进来。
这样可以确保一次只有一个访问。
如果接口一次最多运行固定数目的访问，如10个。那么复杂一些，不过我估计你不是这个情况。一般建议这个固定数目与J2EE容器配置的线程数一致即可。
上述方法都是为了防止接口被同时访问，但这样的后果就是前端用户会等待，甚至线程满。前端等待是没办法的，后面慢，前面只有排队了。线程满的话，最好的方式是采用非阻塞的IO(NIO)，不过那个很难做到。你提出的10秒终止方法是一种方案，不过关键在于如何终止一个方法的运行。
很遗憾，Java不能任意终止一个方法的运行，不过对于接口操作，可以如下处理：
a)
如果接口是TCP/IP，那么可以通过强行关闭socket来终止。如：
timer.schedule(
new
TimerTask()
{
public
void
run()
{
socket.close();
}
},
10000);
b)
如果接口是用类库的话，看看它有没有设置timeout的地方，如果有，那么设置一下，如果没有，那么没办法了。
补充：
你用了axis的setTimeout，理论上超过10秒后call.invoke会抛出异常的。
假设后台很慢，每次都需要10秒，假设weblogic线程池大小为50，那么如果同时访问的人超过50个，或者每秒访问量超过5个，那么就会发生线程阻塞。
这是系统性能问题，可以将weblogic的线程池最大数量设置高些来增加吞吐量。不过这种方式治标不治本，如果你的程序预计到并发访问量很大，那么后台响应超过1秒就不太合理了，这个改动起来就很麻烦了。