JAVA是采用一种称做“字节编码”的程序结构，分为小程序(嵌入到HTML文件中)和应用程序(直接在命令状态下执行)两种类型。无论哪种结构，一旦用JAVAC 命令编译后，均变成后缀为CLASS的同名可执行文件。
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用jd gui可以直接反编译class为java代码。java中的“反编译”命令是用来查看class文件的。在jdk/bin的目录下有个叫做javap的命令行工具。主要是在分析Class文件的时候比较有用。
你说的java源代码是指编译成的class文件前的java文件。
1、Java代码加密：这点因为Java是开源的，想达到完全加密，基本是不可能的，因为在反编译的时候，虽然反编译回来的时候可能不是您原来的代码，但是意思是接近的，所以是不行的。
2、如果你说的是文本加密，有很多方法，自己也可以写个字符变换程序 如果是代码加密，没用的，java就是开源。
3、可以使用Virbox Protector Standalone 加壳工具对java的class类进行加密，支持各种开发语言的程序加密。
PowerDesigner软件 方法/，弹出反向生成类图设置窗口 在反向生成类图设置窗口中，可以选择Java Files或Java Directories等。
PC电脑 PowerDesigner软件 方法/，弹出反向生成类图设置窗口 在反向生成类图设置窗口中，可以选择Java Files或Java Directories等。