至于其他的如md5，hash等，如果从主观可读的角度来说，也可以称为加密。如下的示例是使用Java原生实现RSA的加密解密，包括用公钥加密，然后私钥解密；或者使用私钥加密，然后公钥解密。
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import java.security.interfaces.RSAPublicKey； import java.io.*； import java.math.BigInteger； /** * RSA 工具类。提供加密，解密，生成密钥对等方法。 * 需要到http：//下载bcprov-jdk14-12jar。
非对称密钥——RSA算法 RSA算法是最流行的公钥密码算法，使用长度可以变化的密钥。RSA是第一个既能用于数据加密也能用于数字签名的算法。
非对称加密需要两个密钥：公钥 (publickey) 和私钥 (privatekey)。公钥和私钥是一对，如果用公钥对数据加密，那么只能用对应的私钥解密。如果用私钥对数据加密，只能用对应的公钥进行解密。
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通常比较简单的加密方法就是你把文本文件加载读取以后，得到的每一个char加上一个固定的整数，然后再保存，这样内容就看不懂了。再读取以后，把每一个char减去固定的整数，然后保存，就还原回来了。
这很简单，最简单的加密就是对字节取反，加密和解密都是同一个，很方便。
简单的Java加密算法有：第一种. BASE Base是网络上最常见的用于传输Bit字节代码的编码方式之一，大家可以查看RFC～RFC，上面有MIME的详细规范。Base编码可用于在HTTP环境下传递较长的标识信息。
加密？对文件内容加密？这一般需要设计自己的加密算法和密子。
如果可以随便儿用什么加密方式的话，直接用DES加密就可以。如果非要自己设计一个加密算法，你可以随便指定一个规则，是加减乘除，移位啊取余啊都随便你，最后能按原路算回来就行。
一般来说就是JAVA提供一个可以给C#使用的接口，比如：webservice，或者HTTP接口啥的 ，记得之前远标java讲过这个问题，我先找下资料。
运行此程序的时候需要提供三个参数，如：java Encrypt d：/scr.txt 300 d：/dest.txt 分别表示源文件、长度、目标文件。
这个我不清楚。对文件加密，我使用的是超级加密3000.超级加密3000采用国际上成熟的加密算法和安全快速的加密方法，可以有效保障数据安全！具体操作方法：1下载安装超级加密3000。2 然后在需要加密的文件上单击鼠标右键选择加密。
DES 加密， 建议是将整个文件一次性加密 和 解密， 而不是每行。