当然是全部重画。
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层只不过是制图软件弄出来的一个方便的东西而已。
就像你画画，画上去如果你要擦掉当然是擦到底色咯。（当然GDI+也可以像你画画一样只擦一部分）
GDI+时钟我写过一个VB6的。代码详见我博客。地址显然百度不让贴上= =。所以你可以看下我的资料。
你可以模拟层，就是把所有绘制信息都保存起来。你的流程应当是：
如果要绘制了，更新绘制信息（可以是数组啥的。），交给一个Draw过程
Draw过程：根据绘制信息，全部绘制。
By vIstaswx ,before junior school graduation exam.
继承（Inherits）控件就可以重写它的属性和方法，图标可以在paint中重绘，用gdi，工具主要在drawing和drawing2d中。
combobox弹出的框增加图标吗？个人看法可能需要得到那个句柄，才可以重绘，但那个好像是一体的，不知道能不能弄到句柄。
textbox可以自定义高度。只是以行高度为单位，改变字体大小即可，没必要重写吧。
我也自学，感觉基础容易学，进阶资料少。循序渐进也没序可循，基本是在摸索。
都是想到什么问题，就立下一个目标，然后攻破他，结果可能是尝试几天后，发现目标超出能力范围。
晦涩是相对的，实践出真知，多动手，基础就好了。
绘图代码写在Paint事件中，如
Private Sub Form1_Paint(ByVal sender As Object, ByVal e As System.Windows.Forms.PaintEventArgs) Handles Me.Paint
Dim g As Graphics = Me.CreateGraphics
g.DrawLine(Pens.Red, 100, 100, 200, 100)
End Sub
'方法二：在 PictureBox1上显示图像----图画在Bitmap
PictureBox1.Image = Nothing
Dim wid As Integer = PictureBox1.ClientSize.Width
Dim hgt As Integer = PictureBox1.ClientSize.Height
Dim bm As New Bitmap(wid, hgt)
Dim g As Graphics = Graphics.FromImage(bm)
'画图代码
'画图代码
PictureBox1.Image = bm
PictureBox1.Refresh()
g.Dispose()
如果是简单的移动，先把图形绘制到大小和PictureBox的Bitmap上，然后再绘制到PictureBox就行。
不过在VB.NET中用GDI绘制最好用BufferedGraphics图形缓冲区，速度马马虎虎（VB就这样了），但是不闪烁，不存在背景擦除的问题。