一般来讲，那是不可能的。
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JNI的工作原理，对于native 调用java而言，就是创建VM。
所以vbs中调用本质上与命令行方式没有区别。
当然，如不觉得麻烦，用一个native的wrapper也行。
非一般而言，就是另外一种方式使用gcj之类的编译器编译java程序为native，vbs直接使用native方式。
再非一般，
使用结构通讯方式，java和native都各自修改特定内存结构，但是千万要注意同步的问题。
javolution，protobuf之类如此，还有个chronXXX什么的
C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat 7.0\binwscript "C:\\Program
Files\\Apache Software Foundation\\Tomcat 7.0\\bin\\tomcat.vbs"
C:\Program Files\Apache Software Foundation\Tomcat 7.0\bintomcat
java代码：
Process process=Runtime.getRuntime().exec("cmd /c wscript \"C:\\Program Files\\Apache Software Foundation\\Tomcat 7.0\\bin\\tomcat.vbs\"");
// wait for the process end
process.waitFor();//是返回值
用ScriptEngineManager类中的方法
比如:
//创建脚本引擎
ScriptEngineManager manger=new ScriptEngineManager();
ScriptEngine se=manger.gerEngineByName("VBScript");//脚本类型
se.eval(new FileReader("ex.vbs"));//文件路径
给你个例子吧。
echoargs.vbs 脚本内容如下：
Set objArgs = WScript. Arguments
For x = 0 to objArgs.Count - 1
WScript.Echo objArgs(x)
Next
cmd命令行进入脚本所在目录，运行 echoargs.vbs Hello World
就会将这两个参数分行打印出来。
这种方式相当于 cscript echoargs.vbs Hello World
即前面省略了 cscript （命令行方式调用使用cscript而不是wscript）。
直接在命令行中运行cscript.exe而不加任何参数，会得到使用帮助信息。