由于Windows Server 2003是微软为服务器设计的操作系统，所以微软认为使用服务器进行Internet浏览会增加服务器遭受潜在安全攻击的可能性，因此在默认设置下，Windows Server 2003系统启用了系统内的Internet Explorer增强安全配置。在这种安全设置之下，可以降低服务器遭受潜在安全攻击的可能性，但同时该设置将使部分网页无法正常显示，并且在浏览的过程中经常会发生需要将目标网站加入到信任站点列表后才能够访问的问题，个人用户使用起来会非常不便，因此我们需要改变这项安全设置。
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如果您决定不使用Internet Explorer增强的安全配置，则可通过“开始|控制面板|添加或删除程序”功能，在“添加或删除程序”对话框中单击“添加/删除Windows组件”。在弹出对话框中列出的Windows组件中清除“Internet Explorer 增强的安全配置”的选中状态，然后单击完成，就可以在重启动Internet Explorer浏览器后使增强的安全设置失效。
如果您想保留增强的安全设置功能，而又希望尽量减少它带来的不便，那么可以在打开浏览器时弹出“系统已启动增强的安全设置”警告对话框时，选中左下角的“以后不显示这个信息”对话框来避免每次转到新的网页都收到一次警告。
或者，您也可以点击“开始|控制面板|Internet选项”，在“Internet选项”对话框中单击“安全”选项卡，拉动滑块将Internet、本地Intranet、受信任的站点或受限制站点等区域按照您的需要进行设置
1、禁止危险的服务
2、去掉C盘危险的权限
3、删除危险的组件
4、安装安全防护软件
说起来就这几样，不过具体实施起来就比较复杂了，建议是找专业的安全厂商处理比较好，我以前用的护卫神.入侵防护系统，还送一次人工安全加固，效果很不错，价格还很便宜。
从基本做起，及时安装系统补丁
不论是Windows还是Linux,任何操作系统都有漏洞，及时的打上补丁避免漏洞被蓄意攻击利用，是服务器安全最重要的保证之一。
02
安装和设置防火墙
现在有许多基于硬件或软件的防火墙，很多安全厂商也都推出了相关的产品。对服务器安全而言，安装防火墙非常必要。防火墙对于非法访问具有很好的预防作用，但是安装了防火墙并不等于服务器安全了。在安装防火墙之后，你需要根据自身的网络环境，对防火墙进行适当的配置以达到最好的防护效果。
03
安装网络杀毒软件
现在网络上的病毒非常猖獗，这就需要在网络服务器上安装网络版的杀毒软件来控制病毒传播，同时，在网络杀毒软件的使用中，必须要定期或及时升级杀毒软件，并且每天自动更新病毒库。
04
关闭不需要的服务和端口
服务器操作系统在安装时，会启动一些不需要的服务，这样会占用系统的资源，而且也会增加系统的安全隐患。对于一段时间内完全不会用到的服务器，可以完全关闭；对于期间要使用的服务器，也应该关闭不需要的服务，如Telnet等。另外，还要关掉没有必要开的TCP端口。
05
定期对服务器进行备份
为防止不能预料的系统故障或用户不小心的非法操作，必须对系统进行安全备份。除了对全系统进行每月一次的备份外，还应对修改过的数据进行每周一次的备份。同时，应该将修改过的重要系统文件存放在不同服务器上，以便出现系统崩溃时（通常是硬盘出错），可以及时地将系统恢复到正常状态。
06
账号和密码保护
账号和密码保护可以说是服务器系统的第一道防线，目前网上大部分对服务器系统的攻击都是从截获或猜测密码开始。一旦黑客进入了系统，那么前面的防卫措施几乎就失去了作用，所以对服务器系统管理员的账号和密码进行管理是保证系统安全非常重要的措施。
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监测系统日志
通过运行系统日志程序，系统会记录下所有用户使用系统的情形，包括最近登录时间、使用的账号、进行的活动等。日志程序会定期生成报表，通过对报表进行分析，你可以知道是否有异常现象。