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c语言中，程序运行的时候，首先是找到主函数来运行，其他的函数只有在被调用的时候才会运行。所以对于您给定的程序，系统找到主函数运行，函数体的第一句话是对被调用的函数进行申明，然后定义n为整型变量，s为双精度实行变量，并赋初始值为0。接下来从键盘输入n的值，然后用n和s作为实参，调用fun函数，那么程序就会转到fun函数中运行。定义变量i，然后运行循环语句，i从1到n，对每一个i进行判断，若i能整除5或者能整除9，那么就把1.0除以i的值加入到s中，直到1- n中所有满足条件的值都被加入到s中，整个循环结束，s的值返回到主函数中，然后进行输出。
以上就是函数调用的过程，请您批评指正！
每一个函数调用都会分配函数栈，在栈内进行函数执行过程。调用前，先把返回地址压栈，然后把当前函数的esp指针压栈。
函数调用过程如下：
参数入栈
执行流转到函数开始地址
执行函数
函数执行完毕，返回。
平衡堆栈
大致是这样，根据调用约定不同，可能会有稍许差别。