我提出几点想法，需楼主获取相关文档：
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1、接口开发需对方(也就是你说的读卡器)提供相应接口文档，比如通过什么方法(程序)来获得身份证信息。
2、单凭摸索很难实现，涉及到底层数据流等。
别挺楼上在那瞎知歪
java通过串口就可以跟读卡器建立串口通信。方式是通过用java的com jar包
然后你用的啥读卡器你就按照他们给你提供的资料，给读卡器发送相应的指令数组
数据都是有完整性验证的，数据包开头是06 结束是03
每次发送完指令立马接收反馈，接收反馈一定要用while循环读到03结束符号后才结束读取，否则会出现数据紊乱
读取IC读卡器分很多种，有种最简单的是直接连电脑，使用串口助手软件，选定特定的波特率，就可以接收IC卡号（有些是像RFIC的就需要对其解码）
上面问题解决后，重点的是java如何做一个串口助手，众所周知，java是运行在虚拟机上，也就是要运行在window的一个进程上，如果要java读写串口的话，肯定需要对它进行驱动编写，而不仅仅是加载个jar包就能解决的。
幸运的是SUN公司已经帮我们解决了这个问题，你可以到sun公司网站上下载javacomm20-win32.zip的压缩包，里面就包含了串口的驱动（.dll文件）以及对应的jar包，下载后把.dll文件放到你JDK路径/bin，通过jar包提供的api你就可以操作串口相关的接口了。这里一遍关于java串口使用的文章，希望能提供给您：