串口通信最终都是用二进制传输的，你用代码把二进制转化成十六进制就可以了。不需要额外设置。
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不知道你是不是用51单片机往串口发数据，是的话那是因为51的sbuf最多存放8个字节，所以你发12个字节会分成两次发完。还有在接收的时候最好定义好通信协议，比如加一个侦头，一个侦尾，通过这两个字节的内容来接收数据。
老兄，提问还是给点悬赏分嘛，不要吝啬哪点分，知识是无价的，你给得越多，回答你的人才会越多。
关于串口通讯的问题：
很明显，你还不知道（不会、不习惯）使用事件驱动的方式接收数据。
建议你仔细看看串口组件（无论VB6还是VB.net）的OnComm事件，你的问题很容易解决。
关于以太网通讯：
在TCP通讯中端口确实可以重用，你百度一下“TCP端口重用”能查到很多示例。
但绝大多数情况下不推荐端口重用，而应该采取服务器端建立连接池的方法。
或者，干脆不用TCP，用UDP解决也可以。